有机肥可以提高土壤孔隙度、通透性和植物存活率，增加有益菌、土壤微生物和种群。同时，作物根系形成的优势有益菌群可以抑制有害病原菌的繁殖，增强作物的抗逆性和抗病能力，降低重茬作物的病情指数。连续几年的应用可以大大缓解连作障碍。减少环境污染是一种环保肥料，对人、动物、环境安全无毒。
有机肥料的主要功能 有机肥料的主要作用是增加土壤中的有机质，以激活土壤。当土壤中的有机质增加时，可以形成土壤的颗粒状结构。当土壤正常时，作物的根系可以生长良好，作物更有可能吸收养分，这有利于提高作物产量。 因此，在我们区分有机肥和复合肥的作用后，我们会明白有机肥不是为了增加营养，而是为了调节土壤，因此没有必要注意有机肥中有多少营养元素。
生物有机肥的应用更加灵活。生物有机肥中氮、磷、钾含量相对较低，一般在5%左右，养分含量有限。其主要功能是改善土壤，保持土壤健康。因此，生物有机肥可以作为基肥.种肥.追肥施用不会产生任何不利后果。 因此，虽然生物有机肥是一种新型的有机肥，但其应用与传统的有机肥施用差别不大。只要我们注意到这些点，就会有一定的应用效果。
