看看谷壳的颜色，雄性保持系颜色比较均匀，杂交种水稻种子在颖壳上有略不均匀的黄褐色斑点。保持系和其他混合种子比水稻种子透明。看种子的纯度。用手挑选种子时，如果指尖间出现土粒、砂粒等固体颗粒及其他杂质，并有细粉，则说明种子不符合国家标准的纯度。杂种是异花授粉的，柱头外露。仔细看纹路中间和外侧的裂缝，发现一个小黑点，这是柱头痕。这是鉴别杂种水稻种子和其他水稻籽粒的重要依据。
水稻种子标签是指印刷、粘贴、固定或附加在种子和种子包装表面的特定图案和文字说明。种子标签应当注明以下内容:作物类型、种子类型、品种名称；种子生产者和经营者的信息，包括种子生产者和经营者的名称、种子生产许可证号、注册地址和联系方式；质量指数和净含量；检验日期和质量保证期；品种的适宜种植区域和种植季节；检疫证书编号；信息代码。种子质量有问题的，应当及时向经营单位或者有关部门报告，并出示购买种子时的发票或者收据，保留密封的种子样品原件。
影响水稻种子发芽的外部因素:水稻种子除了种子本身的内部因素外，休眠状态向发芽状态转化还需要三个重要的外部条件，即水分、氧气和温度。只有科学地协调种子与水、氧、温的动态平衡，才能很好地浸种催芽。水:水稻种子吸水是发芽的第一步，即浸种是促进种子吸水的一个技术措施；干燥后的种子处于休眠状态，只有吸收足够的水分后，种子中的生理生化功能才能逐渐开始。种子吸水有三个作用:一是使种皮膨胀软化，有利于溶于水中的氧气随水渗入水稻种子细胞，增强胚和胚乳的呼吸作用。
