近年来有研究表明，单独施用有机肥并不完全适合各种药用植物。比如在人参、西洋参上涂抹人粪，很容易抑制须根的发育。黄芪施用有机肥的效果不如施用专用复合肥。 在施用有机肥的基础上，化肥的施用原则是:慎用化学氮肥，重视化学磷钾肥的配合，巧施中微量元素肥。比如以花、果为药用药材的中草药植物，要注意磷钾肥的施用；以根和鳞茎为药材的中草药植物，应特别注意钾肥的施用。
此外，还有一些既可以有性繁殖又可以无性繁殖的中草药，如地黄、玄参、芍药、甘草、知母、贝母等中草药。种植中药材时，农民要了解每种中药材的特性，并根据中药材的特性加强管理。 种植中药材时要注意间苗、定苗，尤其是出苗后苗密度较高时。要在子叶出土后3-5天内及时疏苗，剔除过密、过细、有病虫害的中药材苗。当幼苗长到10cm左右时，要及时定苗，密植。
提高中药材产量的施肥方法： 种植中药材时，要想增产就要及时施肥。农民在施肥时，应以有机肥为主，化肥为辅，同时均衡施用氮、磷、钾等养分，帮助中药材更好地生长，尤其是在高温多雨的夏季。因为肥料分解快，容易流失，农民要减少养分流失不止一次。 面对花果入药的中药材，要注意磷钾肥的施用；面对根茎类中药材追肥，适当施用钾肥，在中药材根茎膨大期及时追肥，可促进高产优质。中药材施肥总的原则是苗期施氮肥，中后期施磷钾肥。宿根和地下茎药材，整地时施足有机肥。
