菜地施用未分解的绵阳有机肥会产生大量的有机酸、氨、硫化物和二氧化碳等。达到一定量时，会毒害蔬菜的枝、叶、花、果，造成叶、花、果脱落，枝、茎枯萎等。严重的根部会因烧根而腐烂，导致植物枯萎或死亡。未压缩的有机肥含有大量病原微生物、虫卵和杂草种子等。
应用量要合适。 西藏有机肥的施用量不是越多越好，要根据情况适当施用。有机质不足或缺乏的菜地、高产品种、果实采收的蔬菜和低温季节可适当施用有机肥。有机质含量高的菜地、产量低的品种、生长期短的蔬菜、气温高的季节、叶菜类蔬菜，有机肥的施用量可略减。
冬春低温，发酵50-60天即可分解。牛粪等猪粪密闭发酵时，前期较高温度可达60 ~ 70℃。此外，肥料中的大多数病原微生物、害虫、虫卵、杂草种子等会因密闭发酵造成的缺氧和大量有毒气体而被杀死。 如果有沼气池，可以把未消化的猪、牛、人畜粪便放进去，让它发酵产气，然后用沼渣、沼液给蔬菜施肥，生态环保。
