大部分保护区都是封闭设施，成都环保有机肥在分解过程中释放的大量二氧化碳成为光合作用的重要原料来源。而且多施有机肥可以提高冬季大棚土壤的温度，对于冬季大棚生产暖菜非常珍贵。 长期施用有机肥可以提高植物的抗逆性和抗病性，保持蔬菜生产的高产稳产。
菜地施用未分解的绵阳有机肥会产生大量的有机酸、氨、硫化物和二氧化碳等。达到一定量时，会毒害蔬菜的枝、叶、花、果，造成叶、花、果脱落，枝、茎枯萎等。严重的根部会因烧根而腐烂，导致植物枯萎或死亡。未压缩的有机肥含有大量病原微生物、虫卵和杂草种子等。
冬春低温，发酵50-60天即可分解。牛粪等猪粪密闭发酵时，前期较高温度可达60 ~ 70℃。此外，肥料中的大多数病原微生物、害虫、虫卵、杂草种子等会因密闭发酵造成的缺氧和大量有毒气体而被杀死。 如果有沼气池，可以把未消化的猪、牛、人畜粪便放进去，让它发酵产气，然后用沼渣、沼液给蔬菜施肥，生态环保。
